新疆维吾尔自治区档案馆为自治区国家综合性档案馆。它是新疆维吾尔自治区委员会、自治区人民政府直属的科学文化机构，是保存自治区区级机关档案的基地，是科学研究和各方面利用档案史料的中心。

其基本任务是：接收是保管区级机关档案，维护档案的完整与安全，加强档案的科学化和现代化管理，丰富馆藏，建立内容丰富，结构合理的馆藏体系，积极开展档案史料的编研工作，大力开发档案信息资源，提供档案为社会主义各项事业服务，发挥档案工作的社会效益和经济效益。主要职责为负责保管新疆和平解放的革命历史档案及历代旧政权机关和其他单位形成的档案；负责保管新疆和平解放后新疆省级、自治区级机关永久保存的档案以及本地区具有历史凭证作用和科学研究价值的各种门类、各种载体的档案；负责征集、接收本馆管理范围内具有保管利用价值的档案史料，并对馆藏档案进行科学地整理、鉴定、统计和现代人化的管理工作；积极开展档案的利用工作；负责馆藏档案的编辑并参与编史、修志工作。